由于支农北京贷款发放农户贷款的期限偏短和利率上浮较大让农户未享受到优惠，以北京市为例的话截止到今年的十月底辖区内农村社农业贷款余额为35368万元，其中一年以内的贷款余额就为313386万元占了农业贷款余额的百分之八十三；而这些农业贷款由于利率上浮快和生产周期的长短不一，有的则需要3-5年致使部分的农户由于无法按期归还贷款造成了贷款逾期，加大了农业成产成本的同时也给农信社带来了信贷风险。

    支农北京贷款在投放结构上合理度不高，截止到目前北京市农村涉农贷款余额为372282万元其中农户贷款的余额为94369万元，仅仅占涉农贷款余额的百分之二十六，而支农再贷款投放主要比较倾向农村中具有还款能力的富人，而真正能从事农业生产的贫困农民却获取贷款资金的比例很小；另外利率上浮幅度也比较大，支农贷款属于中央银行的低息专项资金，利率的优惠给农村社创造了较大的盈利空间，而农村社使用的再贷款资金向农户发放贷款，按照同档次自筹资金贷款利率执行的话，辖区内农信社对农户贷款利率平均上浮就在百分之七十以上，就造成了农户贷款的成本较高付息压力就比较大也就违背了支农促进农业增效的本意。